肽庫是大量具有特定長(zhǎng)度和不同序列的小肽的集合，包括這種長(zhǎng)度的短肽中各種(或大部分)氨基酸序列的排列組合。肽庫最早是由Geyson等人于1986年提出的。他們認(rèn)為蛋白質(zhì)分子之間的結(jié)合或識(shí)別主要是由局部肽段上的幾個(gè)氨基酸殘基相互作用完成的，這些氨基酸形成非共價(jià)鍵；雖然有些多肽的序列與抗原的天然表位不同，但結(jié)合抗體或配體的方式是相同的，所以這種帶有關(guān)鍵氨基酸殘基的多肽稱為模擬表位。模擬表位的概念對(duì)肽庫的發(fā)展起著重要的推動(dòng)作用。肽庫可以為藥物設(shè)計(jì)、蛋白質(zhì)相互作用等生化和藥物研究應(yīng)用提供有力的工具。

(1)基于已知結(jié)構(gòu)的定制肽庫。

在已知化合物結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，通過以下方法構(gòu)建和設(shè)計(jì)了一系列多肽，并對(duì)目標(biāo)化合物的功能和適應(yīng)癥進(jìn)行了篩選，以期獲得具有靶向藥效的新分子或結(jié)構(gòu)。

n端、C端、側(cè)鏈修飾:酰化、酯化、聚乙二醇化、β-氨基酸取代、D-氨基酸取代、主鏈氨基甲基化、二硫鍵取代、構(gòu)象鎖定(螺旋、β-片)、鏡像多肽、環(huán)肽(端對(duì)端環(huán)化、側(cè)鏈環(huán)化)、特殊分子標(biāo)記、羥基酸取代。

(2)噬菌體展示肽庫。

人工合成編碼隨機(jī)多肽片段的基因，然后將這些基因克隆到噬菌體載體中。利用噬菌體表位展示技術(shù)將多肽展示在噬菌體表面，構(gòu)建了多肽文庫。篩選時(shí)，根據(jù)特異性受體靶標(biāo)與肽庫中某些多肽的特異性相互作用，從文庫中篩選出與特異性靶標(biāo)結(jié)合的多肽。

(3)一株一物化學(xué)組合多肽庫。

組合庫是通過在樹脂上隨機(jī)合成多肽來合成數(shù)千個(gè)多肽的多肽文庫。例如，5肽庫中有55個(gè)五肽，9肽庫中有99個(gè)九肽。然后根據(jù)特異性受體靶標(biāo)與肽庫中某些多肽的特異性相互作用，篩選出與特異性靶標(biāo)結(jié)合的多肽。

(4)DNA編碼的化學(xué)組合多肽庫。

載體樹脂上的隨機(jī)合成肽含有由數(shù)千個(gè)多肽和DNA合成的DNA組成的肽庫，其中合成了幾個(gè)核苷酸來編碼每個(gè)氨基酸的多肽。篩選時(shí)，受體靶標(biāo)需要連接一個(gè)熒光分子。如果多肽與受體結(jié)合，相應(yīng)的樹脂就會(huì)發(fā)出熒光。然后，將這些熒光樹脂作為聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增的模板，然后測(cè)序以獲得多肽信息。

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