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酰胺平面
肽鍵中六個原子C、H、O、N、Cα1、Cα2具有一定的雙鍵特征,不能自由旋轉,這些現(xiàn)象是由共振引起的。結果是肽鍵處于一個剛性平面上,這個平面是肽平面,也稱為酰胺平面。兩個肽鍵平面之間的α-碳原子可以作為旋轉點形成二面角。二面角的變化決定了多肽主鍵在三維空間中的排列,這是形成不同蛋白質(zhì)構象的基礎。
成因
肽平面中的N原子是sp3不等性雜化,具有三個成鍵電子,最初與氫原子呈三角錐結構。但是結合成肽平面是由于空間效應,即N上的未成鍵電子與C和O共軛。因此不能任意旋轉它,因此它形成一個平面。
肽平面的范圍
肽平面圍繞N-Ca鍵的旋轉角度用F表示,而圍繞Ca-C1鍵的旋轉角度用Y表示,順時針方向為正,反時針為負。理論上,F和Y可以在-180°和+180°之間的任何角度上取。生物物理學家G.N.Ramachandran等人構建了一個空間填充肽模型,并計算了多肽鏈F和Y維度上的允許值。用Y繪制F可以得到一個二維圖,稱為Ramachandran構象圖。
二面角
圍繞Cα-N鍵軸旋轉的二面角(C-N-Cα-C)稱為φ,圍繞Cα-C鍵軸旋轉的二面角N-Cα-C-N)稱為ψ,因此多肽鏈主鏈的可能構象可以用φ和ψ這兩個二面角或扭角來描述。ψ的最大允許范圍為-71º-(22o;)或20o;-(+180o;)φ的最大允許面積為-180o;-(-45o;)
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