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1、非HPLC純化的里面有什么雜質(zhì)?
答:粗品和脫鹽等級的修飾肽中修飾肽與非修飾肽類雜質(zhì):如非全長修飾肽和修飾肽后處理的某些原材料如DTT、TFA等。
2、HPLC純化的有什么雜質(zhì)?
答:通過HPLC純化的修飾肽,仍會有很多的雜質(zhì)出現(xiàn),這里面的雜質(zhì)通常是短肽和少許TFA。
3、多長的為適合?
答:修飾肽合成必須考慮修飾肽的長度,電荷,親疏水性等多種因素??傞L度愈長,合成粗品的純度和產(chǎn)出率也隨之下降,純化難度系數(shù)和難以合成的概率便會更大。不過修飾肽功能區(qū)的序列是沒有辦法更改的,但為了修飾肽的圓滿合成,有時候只能在功能區(qū)的上下游添加一些輔助氨基酸,以提升修飾肽的溶解度和親疏水性。倘若修飾肽過短,合成可能會出現(xiàn)問題,首要難題是合成的修飾肽在后處理過程中具有一定的困難,5肽以內(nèi)的修飾肽,通常得有疏水的氨基酸,不然后處理難度較大。15個氨基酸殘基以下的修飾肽一般來說可以得到令人滿意的產(chǎn)出率和得率。
4、怎樣從序列中判斷修飾肽的溶解性?
(1)修飾肽中要是富含高比例的疏水性比較強的氨基酸如Leu,Val,IIe,Met,Phe和Trp,修飾肽不容易溶解于水性溶液中或幾乎無法溶解。這種氨基酸不論是純化或合成,都可能會出現(xiàn)問題。
(2)正常情況下疏水性氨基酸的占比<50%,無法持續(xù)5個接連aa為疏水性,帶電荷的氨基酸的占比可達20%,在修飾肽的N或C短如果可以增多極性氨基酸,也能夠改善溶解性。
5、為何帶有Cys,Met,或Trp的難合成?
答:含有Cys,Met,或Trp的修飾肽無法合成,并且難以獲得純度高的產(chǎn)品。主要是由于這些基團不太穩(wěn)定,易氧化。使用和貯存這些修飾肽都要特別注意,防止重復打開蓋子。
6、為什么有的的合成產(chǎn)率或純度會非常低?
答:修飾肽合成與引子合成有相當大的差異,無法合成的引子非常少,但是經(jīng)常會有無法合成的修飾肽。如Val,Ile,Tyr,Phe,Trp,Leu,Gln,和Thr這樣的氨基酸比鄰或循環(huán)時,修飾肽鏈在合成流程中無法完全舒展溶解,合成效率降低。以下這些情況,合成效率和產(chǎn)物的純度都非常低,如:重復Pro,Ser-Ser,重復Asp,4個連續(xù)Gly等。
7、是怎樣純化的?
答:修飾肽純化一般采用反相柱(如C8,C18等),214nm。緩沖體系一般是含TFA的溶液,pH2.0。BufferA為含0.1%TFAinddH2O,BufferB為1%TFA/ACN/pH2.0。純化之前要用BufferA溶解;倘若溶解欠佳,用BufferB溶解后,隨后用BufferA稀釋;對疏水性高的修飾肽,有時候還要添加少許的FormicAcid或醋酸。
寫到最后:
杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成業(yè)務(wù):藥物肽、臨床肽、訂書肽、淀粉肽、醛肽、環(huán)肽、二硫鍵搭橋多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類酸修飾多肽、各種胺類化合物修飾多肽(苯胺、異戊胺、二乙胺)、各類榮光標記(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、Cy系列)同位素肽等。
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