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本文介紹兩種基本氨基酸:甘氨酸(Gly)和丙氨酸(Ala)。這主要是因為它們可以作為打底氨基酸,給它們添加基團可以生成其他種類的氨基酸。
甘氨酸有一種特殊的甜味,所以它的英文名字來自希臘語glykys(甘甜)。甘氨酸的漢譯不僅有“甜”的意思,而且發(fā)音相近,堪稱“信、達(dá)、雅”的典范。由于甘氨酸的甜味,在食品工業(yè)中常被用作調(diào)味劑,以去除苦味,增加甜味。甘氨酸的側(cè)鏈很小,只有一個氫原子。這讓他與眾不同。它是一種沒有手性的堿性氨基酸。
甘氨酸在蛋白質(zhì)中的特點是體積小、靈活。例如,膠原蛋白的三股螺旋構(gòu)象就非常特殊。每兩個殘基必須有一個甘氨酸,否則會導(dǎo)致空間位阻過大。同樣,一個蛋白質(zhì)的兩個結(jié)構(gòu)域之間的連接通常需要甘氨酸提供構(gòu)象靈活性。然而,如果甘氨酸足夠靈活,其穩(wěn)定性必然不足。
在α-螺旋的形成過程中,甘氨酸是擾流劑之一。原因是側(cè)鏈太小,構(gòu)象根本不能穩(wěn)定。此外,甘氨酸常用于制備緩沖溶液。經(jīng)常做電泳實驗的人一定記得。
丙氨酸的英文名字來自德語乙醛,中文名字比較容易理解,因為丙氨酸含有三個碳,化學(xué)名稱是氨基丙酸。這是一個簡單的名字,就像氨基酸的特征一樣。丙氨酸的側(cè)鏈只有一個甲基,比甘氨酸略大。當(dāng)我畫出其他18種氨基酸的結(jié)構(gòu)公式時,我給丙氨酸加基團。在蛋白質(zhì)中,丙氨酸就像一塊磚,是一種普通的基本建筑材料,與任何人都不沖突。
丙氨酸側(cè)鏈位阻小,位于α-螺旋中,是一種構(gòu)象;β-折疊時也非常穩(wěn)定。在蛋白質(zhì)工程中,如果想要突變蛋白質(zhì)上沒有特定靶點的某個氨基酸,一般可以將其突變?yōu)楸彼?,不容易破壞蛋白質(zhì)的整體構(gòu)象。
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