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細(xì)胞穿膜肽是一種能輕易穿透細(xì)胞膜的小分子多肽。這類分子,尤其是具有靶向功能的CPPs,為藥物高效傳遞到靶細(xì)胞帶來了希望。
因此,對(duì)其進(jìn)行研究具有一定的生物醫(yī)學(xué)意義。本研究主要從序列層面對(duì)具有不同穿膜活性的CPPs進(jìn)行研究,試圖找出影響CPPs穿膜活性的因素,以及不同活性CPPs與非穿膜肽(NonCPPs)之間的序列差異,并引入一種分析生物序列的方法。
根據(jù)CPPsite數(shù)據(jù)庫(kù)和不同文獻(xiàn)獲得CPPs和NonCPPs序列,并從CPPs序列中提取高、中、低穿膜活性的穿膜肽(HCPPs、MCPPs、LCPPs),構(gòu)建數(shù)據(jù)集,基于這些數(shù)據(jù)集,進(jìn)行了以下研究:
1、采用方差分析的方法對(duì)不同活性CPPs和NonCPPs的氨基酸和二級(jí)結(jié)構(gòu)組成進(jìn)行分析。研究發(fā)現(xiàn),氨基酸的靜電和疏水相互作用對(duì)CPPs的穿膜活性有重要影響,螺旋結(jié)構(gòu)和無規(guī)卷曲也影響CPPs的穿膜活性;
2、利用不同活性的CPPs的理化性質(zhì)和長(zhǎng)度在二維平面上進(jìn)行展示,發(fā)現(xiàn)在某些特殊性質(zhì)下,不同活性的CPPs和NonCPPs可以聚類,且HCPPs、MCPPs、LCPPs和NonCPPs被劃分為三個(gè)聚類,表現(xiàn)出了它們之間差異;
3、本文引入了生物序列的理化質(zhì)心的概念,將組成序列的殘基作為質(zhì)點(diǎn),將序列抽象為質(zhì)點(diǎn)系統(tǒng)進(jìn)行研究。將該方法應(yīng)用于CPPs的分析,通過PCA方法,將不同活性的CPPs投影到三維平面上,發(fā)現(xiàn)大部分CPPs聚集在一起,部分LCPPs與NonCPPs聚集在一起。
本研究對(duì)CPPs的設(shè)計(jì)和了解不同活性CPPs序列的差異具有一定的意義。此外,本文介紹的生物序列理化質(zhì)心的分析方法也可用于其他生物問題的分析。同時(shí),它們可以作為一些生物分類問題的輸入?yún)?shù),在模式識(shí)別中起到一定的作用。
寫到最后:
杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成業(yè)務(wù):藥物肽、臨床肽、訂書肽、淀粉肽、醛肽、環(huán)肽、二硫鍵搭橋多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類酸修飾多肽、各種胺類化合物修飾多肽(苯胺、異戊胺、二乙胺)、各類榮光標(biāo)記(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、Cy系列)同位素肽等。固拓生物所有產(chǎn)品僅限科研使用,不得用于人體,如有違反,后果自負(fù)。
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