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多肽純度是多肽總量中的百分比目標(biāo)序列。因為肽鍵的形成不是100% 有效性,并非所有肽鏈都是目標(biāo)序列。有些鏈條可能無法完成,或者氨基酸可能無法在某些鏈條上正確組合。這些刪除序列在你的混合物中形成一定比例的肽。為了實現(xiàn)所需目標(biāo)序列的純度,我們使用反相高效液相色譜和質(zhì)譜進(jìn)行分析和凈化肽。
白色多肽粉末經(jīng)過多肽凈化和凍干后,含有一些非多肽成分,如水、吸附溶劑、計數(shù)離子和鹽。凈肽含量包括肽在最終產(chǎn)品中的實際百分比。這個數(shù)字不同,從50%到90% 不同的是,這取決于純度、合成和凈化的順序和方法。在計算生物分析或其他敏感肽實驗中的肽溶液濃度時,必須考慮肽含量。溶劑的體積可以通過減輕非肽的重量來確定。例如,當(dāng)使用1mg成品時,產(chǎn)量為80% 的1mg/ml 當(dāng)你使用800ull液體時,你將使用800ull液體而不是1000ull液體的溶劑。
肽含量并不代表肽的純度。這是兩種測量方法。純度由高效液相色譜法測量,表明肽的存在/零污染和不希望。凈肽含量僅提供總肽百分比和總非肽成分信息,不同于多肽的出現(xiàn)。通過氨基酸分析或紫外線光度法可以準(zhǔn)確測量凈肽含量。
根據(jù)凍干肽的重量,很難確定具體的肽濃度。冷凍干肽按重量可含10-70% 水和鹽。與疏水肽相比,更親水的肽通常含有更多的水和鹽。如果肽在序列中含有發(fā)色團,(W 或 Y 殘基) ,根據(jù)這些殘基的消光系數(shù),可以很容易地確定肽濃度。
計算可采用以下步驟:
使用1厘米細(xì)胞在中性 pH 下280nm 處發(fā)色殘基的摩爾消光系數(shù):
色氨酸5560AU/mmol/ml
酪氨酸1200 AU/mmol/ml
氨基酸測序中每個發(fā)色團的消光系數(shù)一般被認(rèn)為是相加的,即肽的整體摩爾消光系數(shù)取決于這些發(fā)色團殘基在序列中的類型和數(shù)目。
計算: mg 肽/ml = (A280 x DF x MW)/e,其中 A280是溶液在1-cm 細(xì)胞中280nm 處的實際吸光度,DF 是稀釋因子,MW 是肽的分子量,e 是每個發(fā)色團在280nm 處的摩爾消光系數(shù)。
假設(shè)的例子: 在1-cm 細(xì)胞中,具有序列 GRKKRRQRRRPPQQ (MW = 1847)的肽的50X 稀釋溶液在280nm 處讀取0.5 AU。計算儲備肽溶液中的原始肽濃度:
Mg 肽/ml = (0.5 AU x 50 x 1847mg/mmol)/[(1 x 5560) + (2 x 1200)] AU/mmol/ml = 5.8
注意: 任何吸光度計算都假設(shè)肽是展開的,發(fā)色團暴露在外,通常情況下是短的可溶性肽。如果對肽的溶解度或折疊性有疑問,最好在變性條件下(例如6M GdnHCl 或8M 尿素)進(jìn)行測量。顯然,除非去除變性劑,否則這些肽溶液將變得毫無用處。
如果序列沒有色氨酸或酪氨酸,唯一可行的選擇是做氨基酸分析。
寫到最后:
杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成業(yè)務(wù):藥物肽、臨床肽、訂書肽、淀粉肽、醛肽、環(huán)肽、二硫鍵搭橋多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類酸修飾多肽、各種胺類化合物修飾多肽(苯胺、異戊胺、二乙胺)、各類榮光標(biāo)記(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、CY系列)同位素肽等。固拓生物所有產(chǎn)品僅限科研使用,不得用于人體,如有違反,后果自負(fù)。
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