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偽脯氨酸二肽含有或蘇氨酸形成的惡唑。當(dāng)用三氟乙酸 (TFA) 處理時,惡唑會轉(zhuǎn)化為絲氨酸或蘇氨酸。惡唑類化合物與脯氨酸結(jié)構(gòu)相似,因此被命名為假脯氨酸。與脯氨酸一樣,肽的聚酰胺主鏈中產(chǎn)生“扭結(jié)”,扭結(jié)破壞了負(fù)責(zé)聚集的鏈間氫鍵。將假脯氨酸摻入肽序列中可提高偶聯(lián)效率,進(jìn)而提高肽的純度和產(chǎn)量。與假脯氨酸的偶聯(lián)很困難并且偶聯(lián)產(chǎn)率通常很低。因此,假脯氨酸作為預(yù)先形成的假脯氨酸二肽用于肽合成中。
偽脯氨酸二肽
假脯氨酸在弱酸條件下是穩(wěn)定的,并且可以在2-氯三苯甲基樹脂或Sieber樹脂上制備含有假脯氨酸的肽,并用假脯氨酸就地裂解。
與相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)肽相比,含假脯氨酸的肽具有改善的溶解度。這使得含假脯氨酸的肽更容易純化并用于片段縮合反應(yīng)。此外,在 C 端含有假脯氨酸的肽可以在 C 端殘基不外消旋的情況下進(jìn)行偶聯(lián)。
假脯氨酸在線性肽中產(chǎn)生的扭結(jié)有助于形成環(huán)化肽。據(jù)報道,摻入假脯氨酸可以增加環(huán)化肽的產(chǎn)率并加速環(huán)化反應(yīng)。
假脯氨酸破壞肽鏈之間的氫鍵。
假脯氨酸阻斷天冬酰亞胺副產(chǎn)物和天冬酰亞胺形成所產(chǎn)生的副產(chǎn)物的形成。在大腸桿菌核糖核苷酸 R2 亞基的半合成制劑中,使用 Fmoc-Asp(OtBu)-Ser(ψMe,Mepro)-OH 代替 Fmoc-Asp(OtBu)-OH/Fmoc-Ser(tBu)-OH還原酶。這種方法最近也被用于合成促紅細(xì)胞生成素的糖肽結(jié)構(gòu)域。
偽脯氨酸二肽使用指南
1. 如果可能,在疏水區(qū)域之前插入假脯氨酸。
2. 假脯氨酸之間或假脯氨酸與脯氨酸之間至少應(yīng)有2個氨基酸。
3. 假脯氨酸之間或假脯氨酸與脯氨酸之間的最佳間距為5-6個氨基酸。
寫到最后:
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