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定制合成 Custom synthesis
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之前固拓小編發(fā)過一次固拓生物的#多肽切割操作流程,現(xiàn)在又整理了一波小知識(shí),希望能夠幫助到大家。多肽切割在固相合成中有著很關(guān)鍵的作用,如果切割的干凈,不僅能提高收率也給純化工作帶來便捷。剛剛接觸多肽合成的小伙伴們,通常都會(huì)在切割液的選擇有許多的疑問,那么讓我們聊聊多肽切割的一些小知識(shí)。
切割(Cleavage)屬于肽合成的后處理部分,是指將已合成的肽從載體(樹脂)上切割下來。有人認(rèn)為也包括脫去側(cè)鏈保護(hù)。切割及去保護(hù)是合成中最重要步驟。如果試劑和反應(yīng)條件選擇不當(dāng),產(chǎn)物會(huì)發(fā)生不可逆的修飾而被破壞,因此在切割時(shí)應(yīng)注意以下幾個(gè)問題:
1、選擇合適的試劑濃度、反應(yīng)時(shí)間、溫度等條件;
2、根據(jù)合成肽氨基酸的不同而選擇合適的切割及脫保護(hù)試劑;
3、氨基酸側(cè)鏈的保護(hù),在切割時(shí),切割試劑或切割產(chǎn)物可能對(duì)一些對(duì)其敏感氨基酸側(cè)鏈造成破壞或修飾,因此,反應(yīng)時(shí)要選擇合適試劑和條件,必要時(shí),對(duì)敏感側(cè)鏈進(jìn)行保護(hù),使其遭到最小程度的破壞。
一、什么是“切割”?
固相合成結(jié)束后,如果想從樹脂上切下多肽,需要選擇合適的切割試劑,然后用冰乙醚沉淀,離心采集沉淀物,通過HPLC分離純化,冷凍干燥獲得產(chǎn)品。(下列切割均針對(duì)樹脂進(jìn)行處理)
二、是前后切割過程
三、切割流程
準(zhǔn)備要切割的樹脂
這里只需要樹脂里面的溶劑成分被洗滌掉并充分干燥樹脂,理想狀態(tài)是:像干燥的沙子一樣,不容易占到其它物體的表面,例如瓶子或者紙。
四、切割液的選擇與配置
這方面資料在網(wǎng)上也有很多,針對(duì)不同的多肽序列,選擇不同的切割液種類。
這里主要列幾種常見的切割液比例。
1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5:5:2.5:2.5:2.5
前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種都可以使用。(每1g樹脂加8ml左右的切割液)
當(dāng)然還有很多特殊的切割方法,會(huì)大大提高產(chǎn)物收率,具體的問題,可以聯(lián)系小編13355716090(微信手機(jī)同號(hào))
五、切割過程
一般時(shí)間在2.5小時(shí)左右,要不斷地震動(dòng),溫度為室溫。
有些多肽很容易氧化或變質(zhì),還需要排除容器內(nèi)的空氣(用氮?dú)獯?,有時(shí)還需要適當(dāng)降低環(huán)境溫度,比如0-10℃。
六、抽濾器收集濾液
抽濾的方法很多,每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有自己的方法,小編主要說下,這是的濾液里面含有被切割下來的多肽和一部分側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)。一些不溶于TFA的保護(hù)基團(tuán),例如Pbf,是一種白色漂浮物,同樹脂一起被過濾掉了。
七、沉淀,離心,洗滌
小編認(rèn)為 這個(gè)步驟是最影響收率的一步,處理不好的話,就會(huì)損失很多 多肽。
1)溶劑:沉淀用的是冰乙醚,這里的冰字是要求 乙醚的溫度要很低,例如放置在-20攝氏度的冰箱里面。當(dāng)然使用常溫的乙醚,也是可以的。乙醚和濾液的體積比為6:1比較合適。
2)儀器:能達(dá)到3000轉(zhuǎn)每分鐘的離心機(jī)
3)方法:在時(shí)間允許的情況下,小編建議 把濾液往6倍體積的冰乙醚慢慢地滴加,可以用磁力攪拌器攪拌冰乙醚。目標(biāo)是讓剛加進(jìn)去的濾液立刻析出多肽。
4)離心:把已經(jīng)析出,變白的溶液離心即可。
5)洗滌:一般建議洗滌3次,每一次都要把溶液攪拌均勻。
八、抽干,得到粗品肽
離心3次之后的肽,各種側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)基本被乙醚洗滌了,這時(shí)只要將濕的多肽放到 真空釜 抽干即可。(別放恒溫箱里面)
我相信如果你按照上面的步驟一步一步來,你一定會(huì)得到理想的回報(bào)。因?yàn)楹芏喽嚯亩加凶约旱奶厥庑?,如果遇到一些特殊情況,可以隨時(shí)聯(lián)系小編。
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